آزمایشگاه مرکز ملی تحقیقات شوری با توجه به امکانات خوب و قابل قبول آن، امکان انجام بخش عمده‌ای از آنالیزهای مربوط به نمونه‌های آب، خاک و گیاه را داراست. لیست مربوط به این آنالیزها در جداول مربوطه نشان داده شده است. 

مهمترین وظایف این آزمایشگاه عبارتند از:  

  • مطالعه روش‌هاي مختلف تجزيه‌های آزمايشگاهي و انتخاب مناسب‌ترين روش تجزيه خاك، آب و گياه 
  • انجام تجزيه‌هاي شيميايی مورد نياز طرح‌هاي تحقيقاتی مختلف مركز بر روي نمونه‌های خاك، آب و گياه 
  • انجام آزمايشات فيزيكی و تجزيه‌هاي مكانيكی نمونه‌هاي خاك مربوط به پروژه‌های تحقيقاتی
  • پيش‌بينی و تامين لوازم، مواد شيميايی و تجهيزات آزمايشگاهي برای ستاد مركز و ديگر ايستگاه‌ها 
  • همكاری و هماهنگی با ساير بخش‌های مركز در زمينه فعاليت‌های مربوطه